染色質(zhì)基因分析可識別癌癥起源

白血病細(xì)胞

美國杰克遜實驗室(JAX)的研究人員開發(fā)出一種新方法，通過對開放染色質(zhì)進(jìn)行全基因組分析，來確定導(dǎo)致既定類型白血病的細(xì)胞類型。這一方法對白血病的診療具有重要作用。相關(guān)研究11日發(fā)表在《自然—通訊》雜志上。

每種癌癥都始于一個單細(xì)胞的異變。知道了癌細(xì)胞的起源細(xì)胞，研究人員就可以分析出癌癥的亞型，進(jìn)而開發(fā)出新的診療手段，但現(xiàn)有方法很難從大量腫瘤細(xì)胞樣本中識別出其起源細(xì)胞。

染色質(zhì)是細(xì)胞核內(nèi)的重要成分，由DNA、組蛋白、RNA組成，在細(xì)胞進(jìn)行分裂的特定階段會聚縮成染色體。每種類型的細(xì)胞都有一個獨特的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)，封閉染色質(zhì)會緊緊纏繞在核小體周圍，相對不活躍；開放染色質(zhì)與核小體的聯(lián)系程度則相對松散，也更活躍。杰克遜實驗室的助理教授珍妮弗·特羅布里奇博士通過分析腫瘤細(xì)胞中的開放染色質(zhì)，改進(jìn)了目前識別腫瘤細(xì)胞的起源細(xì)胞的方法。

特羅布里奇帶領(lǐng)實驗室同事構(gòu)建了一個急性髓系白血�。ˋML）的小鼠模型。他們從人類和小鼠的骨髓中找出5種細(xì)胞：長期造血干細(xì)胞、短期造血干細(xì)胞、多能祖細(xì)胞、普通髓系祖細(xì)胞以及粒細(xì)胞巨噬細(xì)胞祖細(xì)胞。這些不同起源細(xì)胞引發(fā)的AML在小鼠身上顯示出不同的侵入性:干細(xì)胞引發(fā)的病變更具侵入性，而祖細(xì)胞引發(fā)的病變的侵入性則要小很多。不同侵入性誘發(fā)白血病細(xì)胞出現(xiàn)的頻率也有所不同:干細(xì)胞高，祖細(xì)胞低。

研究人員通過對不同AML細(xì)胞樣本的開放染色質(zhì)進(jìn)行分析，并與正常細(xì)胞中開放染色質(zhì)模式進(jìn)行對比，進(jìn)而確定了AML細(xì)胞樣本中開放染色質(zhì)的特征和基因表達(dá)模式，這使他們能將干細(xì)胞引發(fā)的AML與祖細(xì)胞引發(fā)的AML區(qū)別開來。

研究人員表示，通過對健康人群和AML患者群的干細(xì)胞和祖細(xì)胞的開放染色質(zhì)進(jìn)行進(jìn)一步研究，他們就可以基于細(xì)胞起源來確定更精確的癌癥生物標(biāo)志，這對于癌癥的診斷和治療具有重要意義。（記者劉海英）